一根一次性棉签，可能隐藏了数万个细菌，容易病从口入，比如乙肝肺结核等疾病。截至2012年，中消协发布消费警示说，国内餐馆配备的牙签许多是三无产品，而国家尚未为牙签制订。因此，消费者每次应只选取一支牙签，用过后即折断，防止二次污染，使用后扔掉。据了解，牙签安全问题在两个阶段可以产生，一是生产阶段，由于一次性棉签制作技术含量低，生产者多为家庭作坊，质量难以保障；二是在使用过程中由于保存不合适，可能造成二次污染。

在购买一次性棉签时，包装袋是否完整是必须查看的。如果包装袋表面不是光滑平整的，而是有凹凸颗粒感的(表明遭受了强力的挤压)，则意味着包装袋可能已有微小的破损，棉签很可能已经受到了细菌的污染。来源于药店的棉签，大多是用塑料包装袋密封的。这种棉签是经环氧乙烷气体灭菌处理的，其保质期为2~3年。棉签牙签OEM厂家建议在购买这种一次性棉签时，一定要注意查看其生产日期以及保质期。

一次性棉签对材质条件要求严格，须具备无毒、无油脂、无苦嗅味，材质自为好,木质细致、硬度大、抗弯力强、弹性与柔韧性能良好，含在嘴里耐磨时间长等条件。此外，日用品OEM厂家选择牙签原木一般要求径级20-40厘米，无腐朽、裂纹、节子、虫眼等缺陷的优质材，尤以当年新伐材最为适宜，隔年旧材对一次性棉签质量有严重影响，应尽量避免使用。

在使用一次性棉签前，韩国普遍使用的也是木头或竹子制成的牙签，而有关淀粉牙签出现的原因，则有一段小小的故事。韩国的一些养猪场通常以饭店的残羹剩饭为饲料喂猪，结果竹子和木头制成的牙签混在饲料中，戳伤猪的脏器，使许多猪出现拒食、腹胀和死亡的现象。有人提议，如果能开发出可以吃的牙签就好了，这样就不会伤害到猪了。没想到此建议一出，立即受到韩国环保部门大力倡导和支持。早在1994年，就有人研制出淀粉牙签并提出zhuanli申请。随后，一次性棉签很快就在韩国全面普及，受到韩国社会欢迎。